Любопытная работа объединившихся исследователей из нескольких американских университетов.

Опубликованная в Nature Communications [1]. Авторы занимались тем, что с января 2021 года методично анализировали пробы из пунктов очистки сточных вод в Нью-Йорке на предмет наличия там последовательностей SARS-CoV-2. И практически сразу они начали находить там странные последовательности, которые не совпадали с последовательностями циркулировавших в Нью-Йорке штаммов коронавируса. С течением времени доля таких последовательностей рола, особенно в образцах нескольких станций очистки. Когда ученые проверили, способны ли псевдовирусы с такими последовательностями уходить от нейтрализующих антител, оказалось, что да, и весьма значительно – вплоть до полного ухода.
#шлемУжаса !
То есть гипотетический вирус, который несет в своем геноме эти участки, был бы
а) нечувствителен к лечению моноклональными антителами
б) мог бы заражать переболевших и вакцинированных.

Остается вопрос, существует ли такой вирус, и если да, то где. И большую часть работы авторы занимались поисками ответов. Даже статья написана не по классической схеме «введение – методы – результаты – дискуссия», а, скорее, по канонам детектива, когда расследователи одну за другой выдвигают гипотезы и проверяют их состоятельность.

#мыБудемВасНемножкоБеспокоить

Зараженные коронавирусом могут выделять вирусные частицы с фекалиями. Вероятнее всего, это не живой вирус, а его остатки, так как выделить активные вирусные частицы из образцов экскрементов за два года пандемии не удалось, но геном таких мертвых вирусов вполне можно использовать для мониторинга. Количество вирусных геномов в сточных водах хорошо отражает динамику эпидемии: когда в регионе болеет много людей, РНК вируса становится больше, когда заболеваемость идет на спад, концентрация генетических фрагментов в образцах тоже падает. До сих пор в большинстве работ, в которых анализировались сточные воды, распределение коронавирусов по штаммам примерно совпадало с тем, что ученые видели, расшифровывая РНК из носоглотки пациентов. Но в сточных водах Нью-Йорка уже в январе 2021 года начали появляться последовательности, не совпадавшие ни с какими из известных штаммов, а начиная с лета в некоторых образцах они и вовсе стали доминирующими.

#СовыНетоЧемКажутся

Часть мутаций таких «вирусов Х» была абсолютно уникальной, другие же больше всего напоминали мутации в спайк-белке омикрона (по техническим причинам, ученые анализировали только последовательность спайка). Первым делом ученые предположили, что «вирус Х» давно существует и циркулирует, но просто до сих пор не попадал в геномные базы данных, так как в США, в общей сложности, расшифровывают 2-10% геномов от всех положительных образцов. Но странные последовательности преимущественно встречались в образцах только из нескольких станций очистки. Если бы они широко гуляли среди людей, такой географический привязки бы не наблюдалось, как не наблюдается ее для вирусов известных штаммов.

#НеНадоУпрямиться !

Второе предположение – «вирус Х» образовался в организме каких-то животных. SARS-CoV-2 может с разной эффективностью заражать сразу несколько видов, и последующие мутации приспособления к новому хозяину могли бы привести к появлению таких странных последовательностей. Ученые провели масштабные хитроумные изыскания, чтобы выяснить, кто из возможных обитателей Нью-Йорка мог бы стать таким новым хозяином, но к окончательному выводу так и не пришли. Под максимальным подозрением крысы, кошки и собаки, но ни для одного вида авторы не смогли найти четких доказательств, что именно в нем сформировался «вирус Х». Да, спайк-белок «вируса Х» хорошо узнает ACE2-рецепторы крыс и мышей, но, во-первых, спайк-белок вариантов бета и гамма тоже неплохо цеплялся к ним, а во-вторых, ученые не проверяли сродство спайк-белка к кошачьим и собачьим ACE2-рецепторам – подозреваю, потому что используемых в лаборатории линий клеток с такими рецепторами просто нет.

Как вариант, разные животные могут быть хозяевами разных вариантов «вируса Х», так как это лишь условное обозначение, и сколько именно разновидностей неизвестного коронавируса в сточных водах, мы не знаем.

#ОгоньИдиСоМной

Наконец, третий вариант предполагает, что
…Продолжение см. ниже

реклама от администратора сайта

Психолог, психотерапевт, психиатр. Консультации кризисных пар. Коучинг. On-line консультации
Терапевтические группы. Обучение на психолога. ИП Юдицкий И.В.
УНП 692150445, 220004, Минск, ул.Мельникайте, 2-503А, +375291188838 (Telegram)
р\с BY36 ALFA 3013 2569 0600 1027 0000, ЗАО “АЛЬФА-БАНК”
ул. Сурганова, 43-47, 220013 Минск, Республика Беларусь. СВИФТ – ALFABY2X, УНП 101541947, ОКПО 37526626
Ссылка на страницу ДОГОВОРА ПУБЛИЧНОЙ ОФЕРТЫ – тут. Посещение – после собеседования по телефону и предоплаты (ч\з кассу любого банка, банкомат, интернет-банкинг с карточек VISA и MasterCard или с помощью расчётной системы ЕРИП). Наличные не принимаются. Портал для безопасной оплаты с карточки: YDIK.COMРасписание (свободное время для записи на консультации и сеансы)

«вирус Х» гуляет по некой замкнутой популяции людей, возможно, с иммунодефицитом. Скажем, среди постояльцев дома престарелых или хосписа. На это может косвенно указывать стабильная локация странных образцов.

Ученые планируют дальше разбираться с происхождением странных последовательностей. Но как бы то ни было, наличие прямо под боком резервуара коронавируса, способного заражать человеческие клетки и потенциально уходящего от имеющихся антител – так себе соседство. Вряд ли кто-то всерьез заинтересуется этой работой: пандемия заканчивается, все торопятся поскорее вернуться к нормальности и вникать в то, что грозит очередными неприятностями и дискомфортом, совершенно не хочется. Оптимизм всегда был присущ человеческой популяции – с катастрофическими последствиями.

Больше #нетМочи

[1] – https://www.nature.com/articles/s41467-022-28246-3

Информация – с публичных страниц вакциноблогера Ирины Якутенко

– Как страшно жить !

Расписание психотренингов в 2022 г. (Школа психофизической регуляции д-ра Юдицкого)